Большинство же выходцев из военных и средних слоев, занимавших высокие позиции при Эхнатоне, сохранили свое влияние в государственных делах — жрецы и военные сумели, наконец, ужиться при царском дворе. Столица Эхнатона — Ахетатон была разрушена и предана забвению. Обнаружили ее наполеоновские войска, затем в XIX веке она была исследована.
При Тутанхамоне столица номинально была возвращена в Фивы, однако фактически своей столицей он избрал Мемфис. В некрополе Саккара были сооружены многочисленные гробницы вельмож, среди них — усыпальницы военачальника Хоремхеба, казначея и архитектора Майа.
По приказу Тутанхамона, помимо реставрационных работ, во многих святилищах была завершена отделка процессионной колоннады Аменхотепа III в Луксорском храме, построен небольшой храм Хорона в Гизе.
Ранняя смерть фараона (умер он в восемнадцатилетнем возрасте) породила много легенд. Долгое время этот факт считали достаточным основанием для того, чтобы утверждать, что смерть была неестественной. Действительно, Тутанхамон мог быть убит по приказу собственного регента Эйе, который стал после смерти Тутанхамона новым фараоном. Но исследования, проведенные в 2005 году, показали, что Тутанхамон мог умереть вследствие травмы — открытого перелома ноги.
Восьмого марта 2005 года ведущий египетский египтолог Захи Хавасс, руководивший исследованием, огласил результаты обследования мумии Тутанхамона. С помощью специального оборудования за пятнадцать минут было получено свыше тысячи семисот трехмерных изображений мумии. Они*то и развеяли большинство устоявшихся мнений относительно смерти юного фараона.